药物分析学系根据已有的课程基础，结合本科生、研究生发展需要，进行了如下的课程设置：

1、本科生
    为药学、临床药学专业的本科生共开设6门课程，包括专业必修课4门：《化学分析》、《仪器分析》、《物理化学》、《药物分析Ⅰ》；专业选修课2门：《药物分析Ⅱ》、《体内药物分析》。
    为生物技术专业的本科生共开设1门课程，包括专业选修课1门：《药物分析》。
2、研究生
开设了8门硕士、博士研究生课程:
①学位基础课2门:《现代色谱技术》、《近代仪器分析基础》
②学位专业课2门:《现代药物分析选论》、《体内药物与毒物分析》
③学位选修课4门:《微流控芯片技术及其应用》、《生物药物分析》、《荧光分析技术在生物分析领域中的应用》、《化学发光在药物分析中的应用》