历史沿革：始建于20世纪50年代，前身是上海医学院药学院分析鉴定科，由许植方创立。1959年设立分析化学教研室，分设分析化学、药物分析两个教学小组，秦芝玲担任首任教研室主任。教研室历经多次拆分、合并、调整，2006年确立为药物分析教研室，2019年定名药物分析学系。1981年取得硕士学位授予资格，2012年获批博士学位授权。历任负责人为秦芝玲、陆明廉、顾志英、袁宝嘉、姚桂根、程务本、吾敏之、郁韵秋、段更利、卢建忠、李嫣。

职能方向：承担药学本、硕、博全层次人才培养、前沿科学研究、行业技术服务三类核心职能，科研层面聚焦药物检测相关前沿技术开发，对接药企、医疗机构、科研院所需求，开展药物、食品、环境多场景样本检测技术研发与成果转化。

师资概况：至2026年12月，药物分析学系有在岗专任教师8人，其中正高级职称5人、副高级职称3人，博导7人，硕导1人，国家级人才1人。

特色研究方向：1）药物筛选与药效评价关键技术，围绕高通量分子筛选、纳米化学生物传感及类器官模型构建筛选与评价平台，快速筛选候选药物，精准评价药物活性、毒性与作用靶点，缩短新药研发周期；2）疾病精准诊疗技术，整合分子探针设计、生物标志物检测与液体活检技术，实现病灶早期识别、分型分层，诊疗一体化，为提升疑难病症诊断准确率与临床干预有效性奠定基础。

标志性成果：学科早期曾自主研制一氧化碳自动报警器，夯实学科科研基础。先后牵头承担国家高技术研究发展计划（863 计划）、国家自然科学基金、国家科技重大专项子平台等多项国家级重点课题。斩获教育部自然科学奖二等奖（第二完成人）、国家海洋局科学技术进步一等奖（第一完成人）、上海市技术发明奖三等奖（第一完成人）等奖项。牵头校级教学改革项目20余项；《药物分析》《仪器分析》获评上海市精品课程、上海高校一流本科课程；主编、副主编专业教材8本，参编教材二十余本。培养学生中1人获教育部博士研究生学术新人奖，1人入选中国科协青年科技人才培育工程博士生专项计划。