复旦大学药理学系坚持以基础和应用基础研究为主，发展创新性研究方向，形成了独特的学科特色。以恶性肿瘤、心脑血管疾病、神经系统退行性疾病、炎性/感染性疾病等重大疾病的治疗为主攻方向，以建立国际规范的新药研发平台为目标，能力建设和人才培养相结合为原则，构建药物靶点确证、药效评价和机理研究的综合性研究体系。“十一五”以来，主持国家科技部973项目两项，国家自然科学基金重点项目两项、面上项目课题十余项，上海市科委浦江人才计划(团队) 两项，上海市科委生物医药重点项目基金两项。发表SCI（IF >2.0）50余篇。同时,有国内外多项发明专利获得授权。