2001/09-2005/07 中国科学技术大学 获化学理学学士
2005/09-2010/07 中国科学院上海有机化学研究所 获有机化学博士学位
2010/07-2013/05 中国科学院上海有机化学研究所 助理研究员
2013/05-2019/09 中国科学院上海有机化学研究所 副研究员
2019/10-至今 复旦大学药学院 副研究员
1. 国家自然科学基金面上项目21472226,发展针对蛋白水解酶的专用亲合性打分函数(主持,已结题)
2. 国家自然科学基金青年科学基金项目21102168,蛋白-蛋白结合界面上特征作用模式的挖掘及其在药物分子设计中的应用(主持,已结题)
3. 安进公司亚洲研发中心资助项目(2017-2019),靶向B类GPCR蛋白的小分子调节剂的设计(主持,在研)
4. 安进公司亚洲研发中心资助项目(2016-2017),发展靶向GPCR蛋白的药物分子设计方法(主持,已结题)
5. 默沙东中国研发中心资助项目(2013-2016),Development of Customized Scoring Functions for Structure-Based Drug Design(主持,已结题)
1. 研究和发展基于结构药物分子设计中的关键理论和方法,包括:建立评价蛋白-配体打分函数性能的方法体系CASF,研究蛋白-配体亲合性计算中的关键因素,发展新一代打分函数,开发全新药物分子设计新方法等。
2. 研究蛋白-蛋白相互作用界面的特征作用模式,发展调控蛋白-蛋白作用体系的小分子设计新策略,并应用于实际的靶标体系中。
3. 以分子模拟为手段研究与重大疾病相关的药物靶标与小分子化合物的相互作用,辅助先导化合物的发现和优化。
作为项目负责人已完成国家自然科学基金青年基金1项以及面上项目1项。作为项目组骨干曾参与国家自然科学基金重点项目、国家重点研发计划项目子课题、中国科学院战略性先导科技专项等科研项目。曾获得知名生物制药企业默沙东(Merck)中国有限公司博士后项目及安进(Amgen)亚洲研发中心的博士后项目资助。现担任美国化学会出版的J. Med. Chem.杂志青年编委。迄今已发表SCI论文40篇,其中通讯作者(含共同通讯作者)和第一作者论文16篇。申请国内新化合物发明专利10项(已授权8项)、PCT专利1项、并获得软件著作权6项。
期刊论文
1. Li, Y.*; Zhang, Z.; Wang, R. HydraMap v.2: Prediction of hydration sites and desolvation energy with refined statistical potentials. J. Chem. Inf. Model. 2023, 63, 4749-4761.
2. Gong, Q.; Wang, H.; Zhou, M.; Zhou, L.; Wang, R.; Li, Y.* B-cell lymphoma-2 family proteins in the crosshairs: small molecule inhibitors and activators for cancer therapy. Med. Res. Review 2023, in press.
3. Ma, Q.; Zhu, L.; Zhang, Z.; Xiong, Y.; Li, Y.*; Lei, X. Synthesis, biological evaluation, and molecular modeling of ORM-10921 and its analogs as a2c-adrenoceptor antagonists. Arch Pharm, 2023, 356, 2300125.
4. Liu, H.; Su, M.; Lin, H.*; Wang, R.*; Li, Y.* Public data set of protein-ligand dissociation kinetic constants for quantitative structure-kinetics relationship studies. ACS Omega 2022, 22, 18985-18996.
5. Li, Y.; Fan, W.; Gong, Q.; Tian, J.; Zhou, M.; Li, Q.; Uwituze, L. B.; Zhang, Z.*; Hong, R.*; Wang, R. X.* Structure-Based Optimization of 3-Phenyl-N-(2-(3-phenylureido)ethyl)thiophene-2-sulfonamide Derivatives as Selective Mcl-1 Inhibitors. J. Med. Chem. 2021, 64, 10260-10285.
6. Zhang L.; Yao, D.; Zhou, F.; Zhang, Q.; Xia, Y.; Wang, Q.; Qin, A.; Zhao, J.; Li, D.; Li, Y.*; Zhou, L.*; Cao, Y.* Sci. Bull. 2021, 66, 1550-1558.
7. Li, Y.*; Sun, Y.; Song, Y.; Dai, D.; Zhao, Z.; Zhang, Q.; Zhong, W.; Hu, L. A.; Ma, Y.; Li, X.*; Wang, R.* Fragment-based computational method for designing GPCR ligands. J. Chem. Inf. Model. 2020, 60, 4339-4349.
8. Li, Y.*; Gao Y.; Holloway, M. K.; Wang, R.* Prediction of the Favorable Hydration Sites in a Protein Binding Pocket and Its Application to Scoring Function Formulation. J. Chem. Inf. Model. 2020, 60, 4359-4375.
授权/申请专利
1. 王任小、洪然,樊文杰,田杰,李嫣,周宓,李晴,孔文娜,李杨峰,李婕,中国科学院上海有机化学研究所,“一种苯基噻吩磺酰胺类化合物、药物组合物、其制备方法和应用”,已授权,专利号:ZL 2019-1-0655053.X,申请日期:2019年7月19日。国际申请号:PCT/CN2020/079854,国际申请日:2020年3月18日。
2. 王任小,洪然,田杰,樊文杰,李嫣,周宓,李晴,孔文娜,李杨峰,李婕,中国科学院上海有机化学研究所,“苯基噻吩磺酰胺类化合物、药物组合物、其制备方法和应用”, 专利授权号:ZL2018-1-1517816.6,申请日期:2018年12月12日。
3. 王任小,李英霞,李嫣,刘瑞齐,向洪刚,王玉杰,周宓,谭畅,李晴,“芳香族化合物、其制备方法、药物组合物和应用”,复旦大学,专利申请号:202210119129.9,申请日期:2022年2月8日。
4. 王任小,柳红,俞飚,李杨峰,李淳朴,李嫣,周宓,李晴,苏敏仪,中国科学院上海有机化学研究所(第一申请单位),中国科学院上海药物化学研究所(第二申请单位),“一种苯基吡唑类化合物、药物组合物、其制备方法及应用”, 已授权,专利号:ZL2018-1-0820154.3,申请日期:2018年7月24日。
5. 王任小,郭春,俞飚,李杨峰,李嫣,安然,徐耀春,周宓,李晴,孔文娜,李婕,中国科学院上海有机化学研究所,“一种噻唑酰胺类化合物、其制备方法、药物组合物及应用”, 已授权,专利号:ZL2018-1-0463002.2,申请日期:2018年5月15日。