历史沿革：成立于2019年，由医院药学教研室和药事管理学教研室整合发展而来。药事管理学教研室成立于1995年，系药剂学教研室下辖三级教学教研机构/三级学科，时任负责人是姚桂根教授；医院药学教研室创建于1999年，是国内最早开展临床药学教学与研究的单位之一，时任负责人是华山医院的张静华老师。2010年，两教研室合并为临床药学与药事管理教研室。2019年更名为临床药学与药事管理学系。历任负责人为蔡卫民、相小强。

职能方向：主要承担临床药学与药事管理学相关教学、科研和社会服务工作，围绕临床合理用药、定量药理学、药物代谢动力学、药品临床综合评价及药事管理等领域开展研究，依托复旦大学附属医院丰富的临床资源，推动临床药学、精准医疗与转化医学协同发展。

师资概况：至2026年12月，临床药学与药事管理学系有在岗专任教师6人，其中正高级职称3人、副高级职称2人、中级职称1人，博导5人，硕导1人。

特色研究方向包括：（1）定量药理学：围绕生理药代动力学模型、群体药代动力学模型、定量系统药理学模型等技术，支撑创新药研发、临床试验设计及精准给药；（2）药物代谢：围绕药物吸收、分布、代谢与排泄过程，开展药物代谢酶、转运体、药物相互作用、药物基因组学研究，为创新药临床开发、个体化用药提供科学依据；（3）药事管理学：围绕药品全生命周期评价、卫生技术评估、真实世界研究及药物政策研究，为药品监管和医疗卫生决策提供循证依据。

标志性成果：在国内率先开展临床药学高层次人才培养，建立本硕博贯通的人才培养体系，为我国临床药学事业培养了大批专业人才。依托上海市定量药理学专业技术服务平台和复旦大学临床药学研究中心，形成了定量药理学与创新药临床评价特色优势；参加国家药品监督管理局药品审评中心多项技术指导原则制定，支持多个创新药完成上市申报，为我国创新药研发、精准用药和药品监管科学发展作出了重要贡献。